澎湖縣商業會成立於民國35年4月15日，成立之初僅有基層公會6個，首屆理事長為郭石頭先生。本會成立之後三易辦公處所，至48年因本縣商業日趨繁榮，商號不斷增加，同業公會相繼成立，商團活動日形頻繁，而會員團體各項活動卻無固定場所，遂由當屆理事長許等爵先生策劃籌建商會會館，於53年4月動工7月完工，興建完成三層樓會館乙棟，自此本會擁有固定會址推展會務。

本會鑑於商業會乃屬於商人的大家庭，為了能夠提供商民適當的聚會及活動場所、提升服務品質、帶動地方經濟發展，乃透過各種管道積極爭取興建人民團體活動中心，在前任陳理事長得水及楊理事長添仁之熱心奔走，以及承蒙本縣王縣長乾同、黃議長建築鼎力協助下，興建一座現代化之人民團體動中心。該中心於85年完工後，本會於10月向澎湖縣政府洽借為辦公室，提供會員多方面的服務，期使本會會務、業務蒸蒸日上。

99年6月，藍俊逸先生當選第25屆理事長，藍理事長年輕有為為人溫文有禮好學不倦，任期內親臨視事，督促各項會務推動，凡各基層公會召開大會，藍理事長必親臨會場祝賀，對本會各項會務的監督更是不遺餘力，經常於上午到達會所批示公文，指揮會務人員辦理各項會務，就任至今已舉辦了多項活動，中小企業經營管理系列講習、績優廠商觀摩暨自強活動、表揚商借模範商號、商人等。